183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1166 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  34.16 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  32.19 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  32.24 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  31.58 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  29.07 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  28.33 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  31.58 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  26.46 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  31.72 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  24.29 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  29.55 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.59 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  30.92 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  27.6 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  27.54 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  35.51 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  29.83 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.27 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  29.08 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  26.6 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  24.34 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  32.97 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  29.24 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  32.38 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  34.35 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.49 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  29.84 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  30.52 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  28.67 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  24.72 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  28.16 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  32.35 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  26.11 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  26.55 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  25.56 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  27.97 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  34.81 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  31.11 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  27.08 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  25.87 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  28.16 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  28.41 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  31 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  31.65 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  25.69 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  25.85 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  25.87 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  25.71 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  25.17 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  33.81 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  29.5 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.87 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.87 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  25.82 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0703  2'-5' RNA ligase  26.86 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  24.75 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  28.99 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  27.54 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  30.5 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  31.37 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  25.6 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  29.05 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  28.97 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  24.46 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>