217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1790 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  44.38 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  40.11 
 
 		 178 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  42.46 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  40.37 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  38.42 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  39.75 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  39.66 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  37.71 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.93 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  39.55 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  38.07 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  37.64 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  38.29 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  36.57 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  35.96 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  34.66 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  35.8 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  35.03 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  36.16 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  35.96 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  43.2 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  36 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  34.83 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  36.57 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  37.14 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  36.47 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  35.39 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  37.71 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  34.46 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  35.59 
 
 		 196 aa  98.2  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  35.59 
 
 		 196 aa  97.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  39.51 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  38.42 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  37.8 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  38.04 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  34.66 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 183 aa  94.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  35.36 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  36.96 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  36.31 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.82 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  35.12 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  32.4 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  26.59 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  27.01 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  36.15 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.57 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.39 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.76 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  31.01 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  28.41 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  24.28 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  23.7 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  29.28 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.05 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.42 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  37.21 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  35.48 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  30 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  30 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  36.43 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  28.33 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.22 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  36.43 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  36.43 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>