174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0674 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  100 
 
 
177 aa  353  5e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  47.78 
 
 
183 aa  150  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  44.83 
 
 
181 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  35.8 
 
 
174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  35.23 
 
 
174 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  41.9 
 
 
183 aa  120  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 
173 aa  120  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 
174 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  44.13 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  38.76 
 
 
187 aa  115  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  35.52 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  39.43 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  39.66 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 
171 aa  108  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  34.97 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  38.46 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  39.56 
 
 
186 aa  105  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  36.76 
 
 
180 aa  103  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.67 
 
 
184 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  35.71 
 
 
193 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  38.25 
 
 
185 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  38.67 
 
 
195 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  37.91 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  36.61 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  36.31 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  34.95 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.9 
 
 
184 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  35.96 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  35.8 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  36.41 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  36.05 
 
 
154 aa  92.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  33.9 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.18 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  36.11 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  33.9 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 
187 aa  85.1  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 
189 aa  84.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  34.07 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  35.94 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.39 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  32.61 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.43 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  31.18 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.77 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.43 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  37.59 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.51 
 
 
199 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  30.18 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  28.4 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  28.87 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  28.99 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  31.46 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  36.11 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  34.83 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  28.4 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  27.81 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  27.22 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  31.76 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  31.49 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  28.92 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  30.63 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  34.93 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  28.92 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  35.57 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  34.9 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  30.19 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  28.33 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  29.59 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>