212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A4815 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  91.16 
 
 
181 aa  343  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  90.61 
 
 
181 aa  342  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  90.06 
 
 
181 aa  338  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  88.95 
 
 
181 aa  338  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  89.5 
 
 
181 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  89.5 
 
 
181 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  89.5 
 
 
181 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  88.4 
 
 
181 aa  333  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  79.56 
 
 
181 aa  308  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  63.54 
 
 
184 aa  250  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  40.78 
 
 
184 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  37.43 
 
 
192 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  33.07 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  29.87 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  29.57 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  31.54 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  26.34 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  23.73 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.3 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  28.83 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.27 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  28.66 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  33.85 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.65 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  30 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  25.52 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  27.88 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.53 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  36.73 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  32.41 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  25.93 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  33.07 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  25.13 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  24.87 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  26.72 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  28.46 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  29.13 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  24.73 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  31.5 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  29.44 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  26.43 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  29.13 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  27.16 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  29.92 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  30.71 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  29.13 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  23.68 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  27.44 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  29.92 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  25.26 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  21.71 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  23.86 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  30.71 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  24.44 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  24.87 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 
192 aa  62  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  33.67 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 
215 aa  61.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  24.86 
 
 
204 aa  61.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  29.01 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  28.81 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  22.14 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  32.65 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>