231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11900 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  35.68 
 
 		 194 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  31.77 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  33.86 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  31.15 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  30.41 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  37.04 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  36.7 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.35 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  32.8 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  30.6 
 
 		 180 aa  94.4  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 187 aa  94.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  34.05 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  26.49 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.61 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  37.37 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  36.02 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  30 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  27.66 
 
 		 188 aa  89  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  26.6 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  26.94 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  33.12 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  28.27 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.85 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  35.58 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  28.27 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  30.16 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  26.94 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  33.87 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  30.06 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.32 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  35.29 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  28.96 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  28.35 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  26.7 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  28.11 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  23.35 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  30.07 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  28.43 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  28.36 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.89 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  32.33 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  31.48 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  29.47 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  25.14 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  33.11 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  28.02 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.94 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>