215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2163 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  36.52 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  34.32 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.4 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  37.16 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  32.77 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  35.26 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  31.82 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  34.09 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.94 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.64 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  36.22 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  31.69 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  32.96 
 
 		 193 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.9 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  32.6 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  32.22 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  32.78 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  32.95 
 
 		 185 aa  84.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  26.59 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  30.51 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  32.22 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  28.98 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  27.07 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  33.87 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.31 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  28.11 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  27.68 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  32.78 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.12 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.41 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  37.37 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  25.68 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.71 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  27.61 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  27.61 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  29.57 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  31.82 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  27.61 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.61 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  27.61 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  26.86 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25.28 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  26.23 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  26.63 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  27.81 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  27.81 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  28.87 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>