145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2113 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 168 aa  319  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  39.56 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  39.23 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  38.76 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  39.44 
 
 		 182 aa  84  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  32.61 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  34.69 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  37.31 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.15 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  36.87 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  37.04 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  38.19 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  38.19 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  34.75 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.35 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  38.19 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  35.33 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.07 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  36.08 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  27.94 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  42.55 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  34.68 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  27.94 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  35.19 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  35.92 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  28.29 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  25.45 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  25.37 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  30.41 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  28.14 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  42.14 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  33.77 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  32.37 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  22.22 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  23.84 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  27.12 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  20.77 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  23.46 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  39.57 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  22.39 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  36.92 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  27.98 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  22.73 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.58 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  44.68 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  34.02 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  36.45 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.75 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  38.54 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  34.31 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  20 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  34.33 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  29.52 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  31.33 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.22 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  28.31 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.12 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  35.38 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  23.13 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  32.47 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  25.76 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  20 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.18 
 
 		 195 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  27.38 
 
 		 197 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  28.14 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  17.18 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  25.38 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  23.48 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  27.59 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  26.79 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  26.95 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  26.15 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  26.15 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  26.15 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  21.48 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>