188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8886 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 190 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  57.78 
 
 		 184 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  46.24 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  41.08 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  43.92 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  39.56 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  41.21 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  39.56 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  37.16 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  42.35 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  36.22 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  39.67 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.02 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  38.78 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.4 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  37.76 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  40.29 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.43 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  34.32 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  35.83 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  28.07 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.14 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  39.16 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  27.75 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  24.28 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25.56 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  36.08 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  37.23 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  30.95 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  35.77 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  38.62 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  34.07 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  26.09 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  26.16 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  27.65 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  37.96 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  25.84 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  37.42 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  36.57 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  24.72 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  36.51 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  26.09 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  37.42 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  34.93 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.24 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.97 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  34.44 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  35.6 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.84 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  25.84 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  25.84 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  34.95 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  39.44 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  25.84 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  32.28 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  31.16 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  38.13 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  24.46 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  25.28 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.48 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.04 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  31.33 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  33.7 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  37.41 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  27.86 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  35.1 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.28 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  25.54 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  34.74 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  27.46 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  33.11 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  31.34 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  32.35 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.07 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  35.04 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  39.38 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>