214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0826 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  49.46 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  46.84 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  47.85 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  44.5 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  40.86 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  38.07 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  38.71 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  37.97 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  35.26 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  35.62 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.78 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  35.26 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  36.31 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.94 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  35.47 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  33.51 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  35.03 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  39.06 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  25.26 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  38.02 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  38.02 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  28.16 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  37.67 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  29.17 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  34.04 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  23.96 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  23.68 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  33.73 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  30.34 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  32.64 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.84 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  35.38 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  22.75 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  34.09 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  31.39 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  35.38 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  25.99 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  33.87 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.1 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  34.17 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.67 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  36.08 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  26.7 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  33.51 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  28.66 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  28.11 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  35.83 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  38.97 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  34.5 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.98 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  23.94 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  28.74 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  40.91 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  31.97 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  30.88 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.88 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  27.51 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  26.63 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.51 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  33.75 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  27.61 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.19 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  27.96 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  26.98 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  27.96 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  29.68 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.96 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  27.96 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.34 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  26.26 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  35.17 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>