200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3716 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  84.54 
 
 		 201 aa  339  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  39.15 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  37.31 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  36.08 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  40.22 
 
 		 189 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  39.29 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  39.15 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  39.29 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  33.86 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  38.78 
 
 		 194 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  35.45 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.74 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  34.57 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  30.89 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  35.71 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  36.56 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  32.99 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  33.7 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  35.26 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  31.02 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  34.38 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.15 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  26.78 
 
 		 171 aa  88.6  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 174 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  36.7 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  36.22 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  27.42 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 174 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  26.13 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  36.3 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  37.67 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.87 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  23.94 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  30.69 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  26.6 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  26.06 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.09 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  30.46 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  31.44 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  34.5 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.03 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  26.95 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  33.67 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  33.85 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  42.65 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  27.1 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  26.46 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  32.12 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.29 
 
 		 184 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.87 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.13 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  25.4 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  24.32 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  24.32 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.32 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  32.18 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  29.44 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  32.66 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  32.02 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.6 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  23.66 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>