204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3287 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  353  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  57.78 
 
 		 190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  45.16 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  43.32 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  43.55 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  42.22 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  43.33 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  43.5 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  39.89 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  42.08 
 
 		 188 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  39.23 
 
 		 168 aa  97.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  27.91 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  30.06 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  34.32 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  27.37 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  35.79 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  39.42 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  38.1 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  24.29 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.12 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  35.98 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  25.42 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.86 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.73 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  38.81 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  38.06 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  33.15 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  24.86 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  24.86 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.86 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.01 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.16 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  34.74 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  37.37 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  36.13 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  34.76 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  38.68 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  35.63 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  34.76 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.33 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  40.91 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  29.21 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  40.91 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  32.34 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  38.42 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  37.23 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  34.04 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  37.43 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  36.96 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  23.74 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  39.39 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  35.1 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  30.83 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  26.01 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.93 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32.33 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  35.42 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  37.43 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  34.55 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  36.84 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  22.67 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  36.3 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  37.31 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  35.34 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  24.65 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  27.95 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  37.91 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  34.78 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  34.98 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  32.84 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  34.36 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  28.92 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  26.74 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  36.54 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  29.05 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>