150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1659 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  34.72 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.74 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  38.69 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  36.22 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  32.39 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  37.58 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  39.02 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  30.67 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.19 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  38.41 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  38.96 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  31.58 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  35.15 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  29.17 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  36.79 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  37.31 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  32.65 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.78 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  33.54 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  33.99 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  34.76 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  27.88 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  32.82 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.05 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.56 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  34.36 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  27.13 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.45 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  33.85 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  25.52 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  26.04 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  29.17 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  23.33 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  27.33 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  27.68 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.07 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  26.19 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.86 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  26.85 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 170 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  31.08 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  24.35 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  27.42 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  23.37 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.07 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  27.04 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  27.92 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.57 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.73 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  24.61 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  33.11 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  30.19 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  23.63 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  33.11 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  30.64 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  30.69 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.88 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.27 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  24.31 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  26.98 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  24.72 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  30.83 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  29.11 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  23.86 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  23.86 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.86 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>