118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1320 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 216 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  43.24 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  38.39 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  35.94 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  36.26 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  38.3 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  31.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  36.05 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  23.57 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  26.37 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.18 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  35.42 
 
 		 177 aa  62  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  30.35 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  33 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  27.34 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  35.46 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  38.61 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  36.62 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.17 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  37.59 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  36.28 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  31.71 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  34.75 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  34.75 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  33.55 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  31.37 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  29.36 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  39.73 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  25.5 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  27.86 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  38.26 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  31.75 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  28.32 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  32.37 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  32.88 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  42.59 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  35.29 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  41.12 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  33.96 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  36.11 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  34.72 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  41 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.87 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  32.12 
 
 		 170 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  33.82 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  32.67 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  37.72 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  33.01 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.19 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  35.06 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  34.75 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.65 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  33.09 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  35.19 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.63 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  26.49 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  29.93 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  36.03 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  32.37 
 
 		 177 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  29.86 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  34.42 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  32.17 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  28.43 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  35.17 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.97 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  33.11 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  26.47 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  34.95 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  35.45 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  35.19 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  35.07 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  37.06 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  29.06 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  35.19 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  31.73 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  28.71 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  28.71 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  30.14 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  28.06 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  35 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  24.52 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  29.45 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  35.54 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  37.14 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  37.38 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>