146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1029 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  38.13 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  38.13 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.44 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.44 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  29.89 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  32.45 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.58 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  32.19 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.42 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  34.48 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.61 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  26.09 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  35.71 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  27.68 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  31.09 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  27.46 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.87 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  32.84 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  28.37 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.46 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  30.11 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  31.95 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  32.83 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.78 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  32.83 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  30.84 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.15 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.88 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  32.37 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.91 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  28.99 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  34.48 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  28.37 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  27.46 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  27.46 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  27.46 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  27.46 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.46 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  37.32 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30.57 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  24.82 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25.17 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  27.68 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  36.11 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  27.97 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  32.14 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  27.96 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  29.57 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  32.85 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  29.36 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  28.02 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  30.14 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  23.63 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  31.39 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  34.01 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>