191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0679 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  61.41 
 
 		 184 aa  247  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  43.02 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  39.11 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  37.43 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  37.99 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  37.43 
 
 		 181 aa  147  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  37.43 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  37.43 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  37.43 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  37.43 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  36.87 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  36.31 
 
 		 181 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  30.96 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  35.92 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  39.84 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  35.66 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.72 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  34.11 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  29.69 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.78 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  35.1 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  33.58 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  33.58 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.34 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  30.95 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  35.94 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  31.25 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  33.83 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.5 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  34.38 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  29.46 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  33.59 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.32 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  35.37 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  32.79 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.59 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  30.41 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  27.46 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  34.88 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  38 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.47 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.47 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  35.1 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  32.32 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  30.92 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  33.56 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  37.86 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  37.86 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  33.54 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  33.54 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  37.4 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  31.78 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  34.95 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  29.75 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  32.91 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  31.78 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  30.49 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  29.69 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  28.12 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  29.69 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  28.04 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.31 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>