213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0923 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 177 aa  361  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  38.46 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  38.1 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  35 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  35.71 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  33.92 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  38.82 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  35.2 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  36.65 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  30.59 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  36.05 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  35.56 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  35.56 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1161  2'-5' RNA ligase  43.02 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.274053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  32.62 
 
 		 217 aa  84.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  38.4 
 
 		 173 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  34.66 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1760  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.907021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  32.2 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  33.72 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  36.63 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2563  2'-5' RNA ligase  40.43 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043811  hitchhiker  0.0000000000000955583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  33.72 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0703  2'-5' RNA ligase  26.01 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2064  2'-5' RNA ligase  34.1 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  30.72 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.94 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3745  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0580  2'-5' RNA ligase  28.09 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  31.18 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  32.56 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3688  2'-5' RNA ligase  27.37 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3871  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0606151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  25.6 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3794  phosphoesterase HXTX  25.79 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  34.15 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.07 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  35.26 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3167  2',5' RNA ligase  29.02 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.592975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  31.72 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  29.77 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  34.09 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  33.88 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  31.5 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.05 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0627  putative 2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  30.89 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  30.92 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.82 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  25.81 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.05 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  38.46 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3896  2'-5' RNA ligase  24.56 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0415456  normal  0.638884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0620  2'-5' RNA ligase  30.85 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.5382  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  28.91 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  35.29 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  35.29 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  35.29 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  31.01 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  26.12 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  28.78 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  34.95 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  27.01 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  29.31 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  30 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  26.17 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  32.2 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  24.18 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>