166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2137 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 220 aa  440  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  44 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  45.4 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  38.97 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  36.17 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  35.66 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  35.66 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  38.1 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.06 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  27.66 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  33.33 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  28.33 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  35.11 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  29.55 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  35.48 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.11 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  24.06 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  34.09 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  28.4 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  29.57 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  30.21 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  27.57 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  27.57 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  29.02 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  30.48 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  29.78 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  33.11 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  29.02 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  30.95 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  33.78 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  33.78 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  25.37 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  33.99 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  30.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  34.52 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.4 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  23.86 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  30.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.27 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  24.21 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  30.87 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  32.02 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2498  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  27.53 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.12 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  30.16 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.41 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  32.87 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>