158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1580 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  51.67 
 
 		 183 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  44.83 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  36.02 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  38.38 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  40.68 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  36.67 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  40.22 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  36.96 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  39.56 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  37.91 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  39.61 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  39.01 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  37.22 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  35.16 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  36.76 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  34.48 
 
 		 171 aa  97.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  34.81 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  34.24 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 200 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  30.6 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.64 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 190 aa  88.6  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.43 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.23 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.55 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  30.56 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  32.03 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  35.11 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  29.78 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  26.59 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  27.43 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  27.78 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  30.69 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  29.61 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  31.34 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  31.37 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  30.51 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  40.19 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  31.01 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  26.57 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  26.57 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  27.68 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  29.85 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  25.17 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  26.57 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  31.29 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  28.17 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  26.79 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  24.48 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  28.89 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  29.13 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  27.53 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>