180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1238 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  66.49 
 
 		 185 aa  242  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  68.31 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  64.13 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  54.21 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  35.91 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  34.92 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  27.51 
 
 		 193 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  35.14 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  28.27 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  32.26 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  30.89 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.49 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.7 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.24 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  34.21 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.29 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  30.92 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  24.04 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  30.69 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  32.61 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  35.33 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  28.8 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  33.83 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.32 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  30.65 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  31.41 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  30.48 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  24.04 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  29.79 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.07 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  36.13 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.05 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  25.7 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  25.7 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  32.17 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  30.87 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.15 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  34.95 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  27.53 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  32.05 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 271 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  34.92 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  32.48 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  31.25 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  26.63 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  33.57 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  28.42 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  30.06 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  28.32 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.1 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  32.2 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  30.87 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  30.2 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  32.54 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  28.12 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>