206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1561 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  67.93 
 
 		 187 aa  278  3e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  66.67 
 
 		 186 aa  256  9e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  73.37 
 
 		 187 aa  250  7e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  43.26 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  45.56 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  41.53 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  38.8 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  39.66 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  38.07 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  37.99 
 
 		 195 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  36.07 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  36.07 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  38.42 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  36.07 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  37.1 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  35.52 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.95 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  32.2 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  32.78 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.9 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.72 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 194 aa  94.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  36.31 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  28.96 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  31.72 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  32.57 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  30.17 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  30.18 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.9 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.32 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  33.89 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.17 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  36.11 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  30.61 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  44.9 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  33.56 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  32.45 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  36.44 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  32.58 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.83 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  35.9 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  30.34 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  33.08 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  34.69 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  39.8 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  32.24 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  31.71 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  26.82 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  32.17 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  31.34 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>