190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1636 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  25.6 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  39.13 
 
 		 179 aa  84.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  31.85 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  42.22 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.38 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  30.27 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.37 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  29.94 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.89 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.66 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  33.58 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  28.35 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  27.94 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  27.13 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  34.88 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  25.28 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.07 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  34.11 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  25.16 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  29.58 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  26.52 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  23.56 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  35.38 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.13 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  31.09 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  24.61 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  27.86 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  35.04 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  27.65 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  29.7 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  34.56 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 298 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  31.43 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  26.5 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  24.46 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  34.56 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  33.33 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  34.56 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  26.62 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  29.09 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  35.21 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  29.1 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  34.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  28.06 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  34.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  33.58 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  34.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  34.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  34.56 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  28.06 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  35.51 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  35.51 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  29.11 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  33.57 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  35.51 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  33.81 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.22 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  23.78 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  36.23 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.25 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  30.83 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>