233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3617 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  100 
 
 
189 aa  367  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  35.11 
 
 
193 aa  124  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  35.11 
 
 
193 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  40.22 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  34.04 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  37.77 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  39.67 
 
 
186 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 
194 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.8 
 
 
184 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  33.87 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  36.16 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  43.57 
 
 
196 aa  94.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  36.16 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  35.71 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  31.72 
 
 
190 aa  92  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 
183 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  35.59 
 
 
184 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  39.04 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  39.13 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  38.59 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.95 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  36.41 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 
177 aa  84.7  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  32.31 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  36.7 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  32.78 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.94 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  29.05 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  36.15 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  35.16 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  27.22 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.89 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  34.3 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.34 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  25 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  28.79 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  31.32 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  36.26 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  24.31 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  33.69 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  22.91 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  31.46 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  30.63 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.81 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  21.08 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  35.84 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  26.24 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.82 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  33.89 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  27.48 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  32.04 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  20.88 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  38.06 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  35.48 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  33.51 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>