205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2282 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  44.51 
 
 		 183 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  38.98 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  33.91 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  32.14 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  30.85 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.12 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.89 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.9 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.09 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30.69 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.15 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  35.56 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  34.31 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.32 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  37.12 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  31.05 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  33.51 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.22 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.35 
 
 		 184 aa  84.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  38.61 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  38.17 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  38.17 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  34.85 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  29.9 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.48 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  28.72 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  32.58 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  23.5 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  33.59 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.82 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  27.91 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  31.78 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  30.54 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  31.87 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  32.99 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  35.07 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  30.66 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  29.26 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  28.11 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  27.13 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  29.37 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  28.36 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  32.84 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  30.59 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  27.85 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  31.54 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  29.57 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  23.56 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  32.06 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  26.37 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  31.44 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  26.63 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  29.77 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  30.87 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  27.91 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  26.55 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  26.8 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  31.62 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  31.3 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  28.03 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  28.03 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.03 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.41 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>