172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0746 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  57.06 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  45.4 
 
 		 220 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  33.5 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  33.87 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  35.54 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  35.59 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  33.92 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  35.48 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.08 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  35.91 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  32.78 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25.68 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  33.87 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  38.06 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  30.94 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  31.02 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  32.24 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  34.32 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  30.48 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.64 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  32.28 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  33.52 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  37.5 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  25.77 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  38.19 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  35.25 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.38 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  29.78 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  25.86 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  31.52 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  27.55 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  40.4 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  38.24 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  27.96 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  26.79 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  30.6 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  32.47 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  34.88 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  31.52 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  32.78 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  26.88 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.75 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  40.4 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  32.85 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  27.43 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  31.64 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  35.26 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  26.01 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  31.49 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  22.65 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.53 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.44 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  28.41 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  27.59 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  27.75 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  33.53 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  24.46 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  32.26 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  34.65 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  26.04 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.04 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.15 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  30.3 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  32.12 
 
 		 216 aa  48.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>