209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0528 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 178 aa  352  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  42.46 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  42.13 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  41.01 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  32.2 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  33.88 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.32 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  32.39 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  28.96 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  26.35 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  30.51 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  38.04 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  28.91 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  36.42 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  33.59 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.11 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  29.48 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  27.43 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  32.52 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  28.68 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  27.84 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2786  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  35.82 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  24.44 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  28.41 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.32 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  28.46 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  27.27 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  27.27 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  28.23 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  28.46 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0703  2'-5' RNA ligase  25.84 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  23.63 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  34.39 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  33.77 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  25.99 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  27.98 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.31 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  31.94 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  31.94 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  31.94 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  32.81 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.31 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  27.64 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  37.3 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  29.66 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  24.18 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  27.64 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  24.73 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  24.73 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  29.27 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  29.27 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  27.82 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.27 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  28.66 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  36.54 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  25.97 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  22.78 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  28.46 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  29.27 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  28.46 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0335  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  32.71 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>