119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2786 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2786  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  47.19 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  45.81 
 
 		 186 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  45.81 
 
 		 186 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  45.81 
 
 		 186 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  45.81 
 
 		 186 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  45.81 
 
 		 186 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  46.37 
 
 		 186 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  45.81 
 
 		 186 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  41.01 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0384  2'-5' RNA ligase  42.61 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0308  2'-5' RNA ligase  44.89 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0335  2'-5' RNA ligase  41.01 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3503  2',5' RNA ligase  40.11 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2702  2',5' RNA ligase  42.61 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0405  2'-5' RNA ligase  42.61 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  34.08 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1728  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  32.02 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  32.4 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  31.55 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  30.66 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.05 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30.17 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.67 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  28.33 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  34.1 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0703  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  26.52 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  35.62 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  34.11 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  37.23 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  30.98 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  27.98 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0580  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  34.21 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  25.67 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  31.52 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  29.07 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  33.15 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  33.02 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  33.02 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  33.96 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  27.65 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  31.53 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  35.77 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  33.02 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  31.54 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  29.58 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  29.58 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  26.9 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  32.56 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  31.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  28.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.64 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  24.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  33.82 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  32.69 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  30.19 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3745  2'-5' RNA ligase  25.82 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  26.62 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3688  2'-5' RNA ligase  25.41 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  30.26 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3871  2'-5' RNA ligase  25.82 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0606151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  24.84 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.94 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  27.22 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  27.47 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  29.44 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  21.16 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  30.97 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>