117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2556 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2556  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2412  hypothetical protein  90.37 
 
 		 187 aa  347  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  26.84 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.12 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  25.13 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  26.23 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  31.18 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  27.41 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  24.34 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  24.34 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  26.98 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  27.78 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  24.1 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  29.08 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  28.14 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  27.13 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  26.78 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  26.09 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  27.23 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  22.7 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  25.65 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  24.47 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  28.06 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  24.06 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  25.32 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  29.22 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  26.59 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  24.1 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  24.1 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  26.92 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  27.94 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  28.3 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  22.22 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  25.67 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  23.13 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  23.03 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  22.73 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  26.81 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  23.91 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  20.94 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  22.1 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  24.06 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  26.88 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  22.16 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  27.61 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  23.08 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  24.67 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  23.44 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  22.11 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  24.37 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  24.29 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  25.85 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  24.21 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  25.17 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2702  2',5' RNA ligase  24.32 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0405  2'-5' RNA ligase  24.32 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  21.08 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  21.08 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  27.37 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  26.8 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  24.23 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  22.22 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  29.2 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  25.19 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  29.2 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  25.67 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  25.48 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  25.19 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  25.19 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  24.82 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  26.24 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  27.73 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.2 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  24.06 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  26.23 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  23.74 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  26.89 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>