89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1290 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  57.59 
 
 		 198 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  52.36 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  52.08 
 
 		 222 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  51.83 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  51.31 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  50.52 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  44.5 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  38.24 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  43.01 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  42.02 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  40.93 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  38.16 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  38.55 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  39.8 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  33.71 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  38.78 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  34.09 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  33.99 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  35.52 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  39.1 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  39.1 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  37.5 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  27.53 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  36 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  38.21 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  36 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  32.16 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  31.82 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  35.54 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  31.06 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  24.43 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  28.48 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  24.82 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  30.11 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.21 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  26.58 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  29.87 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1946  2',5' RNA ligase  30.06 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2563  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043811  hitchhiker  0.0000000000000955583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.34 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.34 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  28.19 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  30.81 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  28.9 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  28.14 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  28.32 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  27.5 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  28.28 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  25.32 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  32.14 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  29.9 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  21.74 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  30.05 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.48 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  27.4 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27110  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 182 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  26.52 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 		 179 aa  42  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  29.82 
 
 		 199 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  27.74 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  28.27 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  25.23 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  24.06 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>