19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1350 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  41.26 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  38.05 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  39.53 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  37.02 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  33.5 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  33.5 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  33 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  34.48 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  30.2 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  36.67 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  33.99 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  31.68 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  30.09 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  30.09 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  32.97 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  32.97 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  31.07 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>