21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4293 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 197 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  69.35 
 
 		 199 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  35.75 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  35.43 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  35.09 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  32.77 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 222 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  30.29 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  32.96 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  32.97 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  36.84 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  30.34 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  30.11 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  28.86 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  30.73 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  31.03 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  27.5 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>