66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01767 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  45 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  42.21 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  44.89 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  42.54 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  43.33 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  42.21 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  39.77 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  39.55 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  41.36 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  36.65 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  34 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  36.76 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  32.04 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  35.68 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  34.25 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  32.11 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  30.32 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  32.57 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  28.26 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  30.53 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.31 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  28.27 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  34.29 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  28.97 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  30.67 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30.3 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  20.57 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  28.89 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  30.57 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  27.54 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  26.85 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3126  2'-5' RNA ligase  23.73 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  25.19 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  30.07 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  26.67 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  33.15 
 
 		 174 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  24.63 
 
 		 187 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  25.56 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  27.84 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>