105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0392 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 691 aa  1340    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  38.57 
 
 		 288 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 277 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  39.17 
 
 		 287 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  35.94 
 
 		 275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  35.48 
 
 		 275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  34.7 
 
 		 284 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  37.35 
 
 		 842 aa  117  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  34.33 
 
 		 486 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.95 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.44 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  29.46 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  30.41 
 
 		 883 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  31.9 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  35.33 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.9 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  30.21 
 
 		 289 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  32.17 
 
 		 283 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 608 aa  72  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.72 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 642 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  31.68 
 
 		 383 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  32.5 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  35.15 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.71 
 
 		 633 aa  68.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  26.32 
 
 		 328 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.96 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  33.73 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.37 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  27.75 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  29.41 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.03 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  27.53 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 752 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 907 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  26.86 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.06 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  31.74 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 1321 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  30.04 
 
 		 291 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4545  hypothetical protein  30.67 
 
 		 314 aa  62  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.83 
 
 		 884 aa  61.2  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.99 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.08 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.92 
 
 		 1290 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.89 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.92 
 
 		 912 aa  59.3  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.64 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.42 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.06 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  32.28 
 
 		 334 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 1332 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  30.17 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  25.45 
 
 		 275 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 384 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.59 
 
 		 306 aa  55.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  26.5 
 
 		 313 aa  55.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  24.72 
 
 		 277 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  27.19 
 
 		 1707 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  29.09 
 
 		 286 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.02 
 
 		 742 aa  53.9  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.09 
 
 		 449 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  25.14 
 
 		 291 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  27.54 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  30.46 
 
 		 276 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  26.19 
 
 		 1028 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  27.71 
 
 		 503 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  28.12 
 
 		 294 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.17 
 
 		 1694 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  27.72 
 
 		 1059 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  30.2 
 
 		 260 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  26.45 
 
 		 300 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  24.39 
 
 		 263 aa  48.9  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.94 
 
 		 1007 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  27.2 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 470 aa  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  30.72 
 
 		 337 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  29.01 
 
 		 271 aa  48.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.61 
 
 		 290 aa  47.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  26.29 
 
 		 388 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 286 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.53 
 
 		 328 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  26.09 
 
 		 300 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  30.06 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.68 
 
 		 819 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  27.62 
 
 		 1441 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 		 283 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 283 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 283 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 191 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 291 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>