More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3129 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  100 
 
 		 452 aa  888    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  91.59 
 
 		 452 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  77.04 
 
 		 453 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  72.91 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  72.46 
 
 		 447 aa  591  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  70.68 
 
 		 452 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  35.44 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 438 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  32.2 
 
 		 459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  31.32 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 450 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  34.49 
 
 		 469 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 462 aa  183  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  32.44 
 
 		 468 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  31.35 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  29.85 
 
 		 408 aa  161  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  31.7 
 
 		 472 aa  153  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  28.6 
 
 		 547 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  28.6 
 
 		 546 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  28.6 
 
 		 547 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  28.6 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  28.6 
 
 		 546 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  28.38 
 
 		 484 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  28.48 
 
 		 495 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  29.44 
 
 		 502 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  29.73 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  28.88 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  28.67 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 518 aa  140  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 500 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  28.63 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  27.41 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  27.41 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  27.41 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 463 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  28.44 
 
 		 480 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.6 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 464 aa  126  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.74 
 
 		 463 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.45 
 
 		 464 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.93 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.93 
 
 		 463 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 481 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 450 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  26.02 
 
 		 501 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.45 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  29.37 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 498 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.78 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>