More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7123 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  49.26 
 
 		 214 aa  171  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  88.06 
 
 		 71 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.37 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  31.35 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  45.98 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.34 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  35.05 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.5 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  47.78 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  38.39 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
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NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
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NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
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NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  32.32 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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