More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0706 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 206 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 223 aa  167  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  38.52 
 
 		 145 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 87 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 268 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>