50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27610 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03680  transcriptional regulator, tetR family  30.72 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12460  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08190  transcriptional regulator, tetR family  25.15 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.137766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  23.44 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  34.67 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25.51 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 222 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  32 
 
 		 153 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 231 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 424 aa  41.6  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>