73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05238 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001349  transcriptional regulator LuxT  93.46 
 
 		 153 aa  298  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000649622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0321  TetR family transcriptional regulator  74.83 
 
 		 161 aa  246  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  76.47 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02176  hypothetical protein  42.48 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3810  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3198  transcriptional regulator, TetR family protein  40.4 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0648  TetR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0903763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0771  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 184 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 228 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 223 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  23.73 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  27.61 
 
 		 246 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  32 
 
 		 221 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 193 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 205 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  29.21 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1617  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.0770376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  24.32 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  32.1 
 
 		 219 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 213 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  27.54 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 208 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 197 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>