89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0648 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0648  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  322  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0903763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3810  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 159 aa  191  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  55.03 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  53.69 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 159 aa  183  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 159 aa  183  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 159 aa  183  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3198  transcriptional regulator, TetR family protein  55.7 
 
 		 158 aa  173  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0771  TetR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0321  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000162147  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  42.18 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001349  transcriptional regulator LuxT  42.86 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000649622  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  44.9 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02176  hypothetical protein  44.95 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.62 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.48 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.21 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.31 
 
 		 216 aa  44.3  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  43.9  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  32.26 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 470 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.26 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 195 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 201 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.87 
 
 		 217 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 209 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 211 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 396 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 214 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03680  transcriptional regulator, tetR family  25.74 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.15 
 
 		 224 aa  40.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>