98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0616 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  76.47 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001349  transcriptional regulator LuxT  75.16 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000649622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0321  TetR family transcriptional regulator  71.52 
 
 		 161 aa  235  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000162147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02176  hypothetical protein  41.56 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  50.96 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0648  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0903763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3810  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0771  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3198  transcriptional regulator, TetR family protein  39.33 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 199 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 189 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  24.19 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 213 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 188 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.09 
 
 		 218 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.09 
 
 		 218 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 264 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.09 
 
 		 218 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 223 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 213 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 187 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  24.29 
 
 		 246 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 193 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 213 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  28.16 
 
 		 233 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  25.3 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  33.87 
 
 		 241 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 208 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.66 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  25.66 
 
 		 211 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.66 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.66 
 
 		 211 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.66 
 
 		 211 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.66 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 208 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  33.33 
 
 		 219 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 195 aa  40.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 243 aa  40.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  32.69 
 
 		 218 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>