47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0771 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0771  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3810  TetR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 162 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  56.29 
 
 		 159 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 159 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 159 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 159 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 159 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0648  TetR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0903763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3198  transcriptional regulator, TetR family protein  53.33 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001349  transcriptional regulator LuxT  45.45 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000649622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0321  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000162147  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  44.16 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  44.16 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02176  hypothetical protein  40.31 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.12 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.51 
 
 		 218 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 176 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.51 
 
 		 218 aa  42  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 195 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.51 
 
 		 218 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.2 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 220 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  25.74 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 195 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.9 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03680  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  35.29 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>