74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001349 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001349  transcriptional regulator LuxT  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000649622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  93.46 
 
 		 153 aa  298  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0321  TetR family transcriptional regulator  73.51 
 
 		 161 aa  244  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  75.16 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02176  hypothetical protein  43.14 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3810  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  42.76 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0771  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3198  transcriptional regulator, TetR family protein  40.4 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0648  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0903763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 223 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 202 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 224 aa  43.9  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  24.58 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 215 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 188 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  32.94 
 
 		 246 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 208 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  22.38 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1617  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.0770376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  28.99 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  32.26 
 
 		 241 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  22.97 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  32 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 209 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  32.43 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 218 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 188 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 178 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 197 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>