82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02176 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02176  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  321  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001349  transcriptional regulator LuxT  43.14 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000649622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0321  TetR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  41.56 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  42.48 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3810  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0648  TetR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0903763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3198  transcriptional regulator, TetR family protein  37.42 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0771  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 239 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  30.12 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  30.12 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  30.12 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  30.12 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  30.12 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  30.12 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  30.12 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  36.21 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  36.51 
 
 		 241 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  35.14 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 244 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 221 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 210 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 223 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  27.69 
 
 		 219 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.5 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 242 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  20.8 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 208 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 189 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>