65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0321 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0321  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000162147  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05238  hypothetical protein  74.83 
 
 		 153 aa  246  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001349  transcriptional regulator LuxT  73.51 
 
 		 153 aa  244  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000649622  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0616  HTH-type transcriptional regulator LuxT  71.52 
 
 		 153 aa  235  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0291475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0733  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02176  hypothetical protein  43.05 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0648  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0903763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3810  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3198  transcriptional regulator, TetR family protein  40.52 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0771  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 230 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 223 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 228 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 197 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 216 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  43.9  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.5 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  30.56 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  31.65 
 
 		 246 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 87 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 224 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 193 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 193 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 193 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 223 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 193 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 208 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 202 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  27.54 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>