83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12460 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12460  transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  473  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08190  transcriptional regulator, tetR family  61.82 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.137766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03680  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27610  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.424005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17710  hypothetical protein  25.14 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.746787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  25.74 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  25.74 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  45.83 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4749  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0939  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3743  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3421  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0914  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0948  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.961302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3067  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00227859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3084  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.012098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0888  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00720668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0851  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  33.82 
 
 		 206 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  21.9 
 
 		 221 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 198 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>