More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1162 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  49.34 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  46.19 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  45.41 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  45.87 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  43.12 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  43.2 
 
 		 215 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  46.76 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 337 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  43.78 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  41.96 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  43.5 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  40.45 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  41.9 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  40.09 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  39.71 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  39.52 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  38.76 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  40.3 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  37.27 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 216 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  41.82 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  39.51 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  45.03 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  37.26 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  36 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  39.18 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  40.2 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  32.26 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  35.35 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  32.7 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.18 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  38.97 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  36.84 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  38.29 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  31.43 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  35.91 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.04 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.42 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  38.37 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  40 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  35.87 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.18 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.02 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.34 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  40.25 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  33.63 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  36 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  33.62 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  28.71 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  32.27 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.94 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.93 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  32.86 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.72 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>