More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1118 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.07 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  40.24 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.02 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  49.18 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  25.15 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  41.54 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.51 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.51 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>