More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2119 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  53.41 
 
 		 810 aa  843    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  51.95 
 
 		 907 aa  839    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  44.74 
 
 		 806 aa  683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  44.7 
 
 		 816 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  48.43 
 
 		 809 aa  751    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  46.98 
 
 		 786 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  45.11 
 
 		 808 aa  657    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 810 aa  1650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  45.7 
 
 		 789 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  43.93 
 
 		 785 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 		 795 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  41.61 
 
 		 782 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 852 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  40.75 
 
 		 767 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  39.75 
 
 		 769 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 812 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 824 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 809 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 789 aa  227  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 795 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 794 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 791 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 776 aa  212  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 850 aa  207  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 843 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 859 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 793 aa  198  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 837 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 860 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 862 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  24.64 
 
 		 807 aa  188  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 805 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 817 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 815 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 825 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 825 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  26.37 
 
 		 792 aa  180  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 864 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 711 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 730 aa  170  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 806 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 713 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.3 
 
 		 709 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  23.5 
 
 		 786 aa  164  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.74 
 
 		 801 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 708 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 742 aa  158  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 767 aa  158  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  32.61 
 
 		 814 aa  157  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  25.89 
 
 		 713 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.33 
 
 		 713 aa  154  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 743 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 723 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 726 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 715 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 797 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 741 aa  149  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 740 aa  149  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 696 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  24.27 
 
 		 691 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 727 aa  147  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.21 
 
 		 696 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.69 
 
 		 703 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1152  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 790 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 701 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 781 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 707 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  24.97 
 
 		 716 aa  142  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 719 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.01 
 
 		 708 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 770 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 710 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 796 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 771 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2327  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 790 aa  137  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929044  normal  0.271692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.24 
 
 		 806 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 710 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 710 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 703 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 735 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 724 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.03 
 
 		 722 aa  134  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  25.36 
 
 		 733 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 701 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 730 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 715 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 706 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6367  TonB-dependent siderophore receptor  24.59 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.52 
 
 		 797 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 757 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 706 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 706 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 723 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 733 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>