101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2749 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2749  YD repeat protein  100 
 
 		 2808 aa  5558    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  44.14 
 
 		 2843 aa  94.4  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2094 aa  75.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  28.9 
 
 		 2443 aa  71.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  28.57 
 
 		 2554 aa  66.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  32.47 
 
 		 2558 aa  64.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  30.81 
 
 		 2350 aa  63.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  33.54 
 
 		 1053 aa  62.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  34.9 
 
 		 2510 aa  62.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  31.48 
 
 		 298 aa  60.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  31.48 
 
 		 298 aa  60.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  23.27 
 
 		 2486 aa  59.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  34.1 
 
 		 2585 aa  59.7  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  37.38 
 
 		 952 aa  59.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  31.48 
 
 		 316 aa  58.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  42.31 
 
 		 207 aa  58.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  34.26 
 
 		 2534 aa  58.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  26.43 
 
 		 2145 aa  58.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  34.69 
 
 		 2652 aa  56.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  26.11 
 
 		 2374 aa  55.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  33.96 
 
 		 2194 aa  55.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.93 
 
 		 678 aa  55.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  27.67 
 
 		 955 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  32.46 
 
 		 2003 aa  54.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  25.87 
 
 		 1140 aa  55.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  33.63 
 
 		 927 aa  53.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  29.49 
 
 		 2479 aa  54.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  26.8 
 
 		 881 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2277 aa  53.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  35.64 
 
 		 809 aa  53.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0133  hypothetical protein  35.87 
 
 		 520 aa  53.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.800968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 2961 aa  53.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  37.25 
 
 		 920 aa  52.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  36.63 
 
 		 980 aa  52.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1157 aa  52.8  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1834 aa  52.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  34.62 
 
 		 886 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  36.11 
 
 		 2417 aa  52.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  36.11 
 
 		 2458 aa  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  31.3 
 
 		 1381 aa  52.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  33.02 
 
 		 2286 aa  52.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  28.32 
 
 		 554 aa  52.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  35.25 
 
 		 2387 aa  52.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  33.59 
 
 		 1998 aa  52  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  32.97 
 
 		 391 aa  51.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 451 aa  52  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  34.23 
 
 		 2615 aa  51.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3166  YD repeat protein  45.16 
 
 		 2542 aa  50.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000422225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  26.47 
 
 		 1463 aa  51.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  32.89 
 
 		 1023 aa  50.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  40.37 
 
 		 1345 aa  50.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  40.37 
 
 		 1345 aa  50.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  31.91 
 
 		 1953 aa  50.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  31.73 
 
 		 302 aa  50.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  22.6 
 
 		 1427 aa  50.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.49 
 
 		 1976 aa  50.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  50.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1825 aa  50.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  20.95 
 
 		 1753 aa  50.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  36 
 
 		 1008 aa  50.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  36 
 
 		 1008 aa  50.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  33.67 
 
 		 2698 aa  50.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1602 aa  50.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1825 aa  50.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  30.57 
 
 		 1740 aa  50.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1271 aa  50.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1806 aa  50.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  32.32 
 
 		 2290 aa  50.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  30.88 
 
 		 2225 aa  49.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  29.46 
 
 		 956 aa  49.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  33.96 
 
 		 1599 aa  48.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1917 aa  48.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4091  hypothetical protein  29.45 
 
 		 401 aa  49.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  28.06 
 
 		 2165 aa  49.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  35.29 
 
 		 940 aa  48.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1942 aa  48.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  34.34 
 
 		 962 aa  48.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  34.34 
 
 		 962 aa  48.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 3333 aa  48.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  32.2 
 
 		 1464 aa  48.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  34.34 
 
 		 958 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  30.53 
 
 		 1485 aa  48.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  35.64 
 
 		 913 aa  48.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  22.43 
 
 		 741 aa  48.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  45.31 
 
 		 2046 aa  47.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3077  hypothetical protein  34.26 
 
 		 299 aa  47.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  33.9 
 
 		 2418 aa  47.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  34.65 
 
 		 902 aa  47.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  33.67 
 
 		 3193 aa  47.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0314  hypothetical protein  35.56 
 
 		 243 aa  47  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00124228  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  24.6 
 
 		 928 aa  47  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  31.17 
 
 		 628 aa  47  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1147 aa  47  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1181  wall-associated protein  30.69 
 
 		 241 aa  47  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.2 
 
 		 3027 aa  46.6  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1935 aa  46.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  33.9 
 
 		 1892 aa  46.2  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1433 aa  46.2  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  23.11 
 
 		 2447 aa  46.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  32.73 
 
 		 1485 aa  46.2  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>