70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0631 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  98.4 
 
 		 377 aa  739    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  752    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.39 
 
 		 485 aa  76.3  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  23.59 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.15 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  21.04 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  21.77 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  22.01 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  26.91 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1824  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  21.71 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  20.91 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  22.96 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4294  putative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  21.36 
 
 		 448 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  25 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  27.06 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  22.04 
 
 		 572 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  20.93 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  20.54 
 
 		 468 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2084  divergent AAA region  29.36 
 
 		 135 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.497784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  20.19 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  22.16 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  21.66 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  22.35 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  22.35 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 433 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  20.48 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  32.8 
 
 		 207 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 		 469 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5429  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0712  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.852525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  20.24 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  22.19 
 
 		 469 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  20.81 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 230 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  21.74 
 
 		 394 aa  46.2  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  33.91 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  26.55 
 
 		 777 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 663 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  20.85 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  21.14 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  26.67 
 
 		 773 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  22.67 
 
 		 498 aa  43.5  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2925  divergent AAA-4 ATPase related protein  27.52 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  28.91 
 
 		 586 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04685  succinate dehydrogenase  29.03 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>