33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1641 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  57.31 
 
 		 777 aa  904    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1641  AAA-4 family protein  100 
 
 		 773 aa  1580    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.49775  hitchhiker  0.0026953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1312  AAA-4 family protein  92.51 
 
 		 774 aa  1442    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201459  normal  0.370509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  68.48 
 
 		 770 aa  1048    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1391  putative transcriptional regulator  38.29 
 
 		 586 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  26.56 
 
 		 943 aa  64.3  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  24.76 
 
 		 931 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  23.38 
 
 		 929 aa  57.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  23.66 
 
 		 896 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  24.5 
 
 		 251 aa  54.3  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  23.93 
 
 		 955 aa  53.5  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 389 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  25.1 
 
 		 894 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  28.44 
 
 		 462 aa  50.1  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  25.1 
 
 		 894 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  26.21 
 
 		 895 aa  50.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  38.6 
 
 		 407 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 240 aa  48.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  35.71 
 
 		 401 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  34.88 
 
 		 486 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2401  PHP-like  26.25 
 
 		 221 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  45.28 
 
 		 297 aa  46.6  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 385 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 620 aa  45.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  30.19 
 
 		 278 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0698  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 		 299 aa  45.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  23.68 
 
 		 909 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1616  hypothetical protein  39.62 
 
 		 334 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  29.82 
 
 		 280 aa  45.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0385  PHP-like  27.85 
 
 		 227 aa  44.3  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.838582  normal  0.0911256 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1418  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 		 299 aa  44.3  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.105026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  50 
 
 		 232 aa  44.3  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 374 aa  44.3  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>